Il controllo del rispetto delle norme di qualità è garantito da un Organismo di controllo che, per conto di AGEA, svolge le verifiche di conformità alle norme di commercializzazione applicabili nel settore degli ortofrutticoli freschi, l’AGECONTROL. Dal 2006 è presente al CAR un ufficio dedicato agli operatori ed ai produttori del Centro che verifica le merci commercializzate.